2 × Phanta Max Master Mix
高效扩增,轻松突破长达40 kb的λDNA/质粒和20 kb的gDNA
分子克隆;基因鉴定;多重PCR;高AT/GC体系
· 保真度高:保真度是 Taq DNA Polymerase 的 128 倍
· 扩增更快:30 sec/kb 可高效扩增绝大多数片段
· 扩增更长:质粒、λDNA 等简单模板有效扩增长度可达 40 kb, cDNA 有效扩增长度可达 10 kb,基因组有效扩增长度可达 20 kb
· 适应性广:GC含量兼容范围24-83%,兼容粗品和样本直扩
· 操作便捷: 加入引物和模板即可进行扩增,减少实验操作的步骤
1.保真度高
采用二代测序方法(P. Mielinis. et al. Journal of Molecular Biology (2021)),测定不同聚合酶的扩增保真度。结果显示,Phanta Max Super-Fidelity DNA Polymerase保真度是Taq DNA Polymerase的128倍。
图1
2. 优异的高GC 扩增能力
以人基因组为模板扩增 654 bp、 900 bp、 800 bp、 1,200 bp、 1,400 bp、426 bp 目标片段,各扩增子 GC 含量均高于 68%。
图2
3. 稳定的粗品扩增能力
图3
本产品添加了延伸因子、特异性促进因子以及平台期解抑制因子,使其在长片段扩增能力、扩增特异性以及扩增产量方面得到了大幅度提升。保真度是Taq酶的128倍,可进行高特异性的热启动PCR。本产品只需加入引物和模板即可进行扩增,减少了移液操作,提高了检测通量和结果的重现性。使用方便,只需加入模板和引物即可进行扩增。产品经反复冻融后仍能保持稳定的活性。
组分 | P515-01 | P515-02 | P515-03 |
2 × Phanta Max Master Mix | 1 ml | 5 × 1 ml | 15 × 1 ml |
-20°C保存
Q1:扩增效率低,实验组无扩增条带。
A1:(1) 引物
检查人工合成的引物是否因存储条件不当而降解;引物设计是否合理,可利用BLAST检查引物特异性或重新设计引物。
(2) 模板
长期放置、反复冻融会导致模板断裂、开环或降解,应使用新鲜制备的DNA双链作为模板;模板GC含量过高会导致DNA的双链无法打开,此时加入PCR Enhancer(货号P021),可以有效降低解链温度;模板为粗品,存在抑制物,建议降低模板浓度(稀释使用;若样本为植物叶片,要确保植物为非多糖多酚植物,取新鲜幼嫩的叶片,并将叶片面积剪小,如黄枪头尖部面积大小);若模板为cDNA,要确认逆转录所用RNA的纯度及完整度。
(3) 酶
反应所用的酶失活,建议更换新酶或用另一来源的酶重新实验。
(4) 扩增体系
反应体系配制错误,建议重复实验。
(5) 反应程序
检查变性温度是否准确,PCR仪指示温度与实际温度是否相符,如果温度过高,酶在前几个循环就迅速失活,温度过低则模板变性不彻底;若模板为酵母菌,可将预变性时间延长10min;退火温度不合适,可对退火温度设置梯度,摸索合适的退火温度;如果目的片段较长,可尝试Touch Down 程序;检查延伸时间是否充足。
Q2:扩增的条带亮度不太亮。
A2:(1) 引物
检查人工合成的引物是否降解。
(2) 模板
首先确认模板的质量,长期放置、反复冻融会导致模板断裂、开环或降解,应使用新鲜制备的DNA双链作为模板;如果模板没有了,可用首次扩增产物按倍比稀释后作为模板进行二次扩增。
(3) 反应程序
可尝试使用Touch Down程序;延长延伸时间,提高循环数。
Q3:扩增特异性差,非特异性扩增。
A3:(1) 引物
引物设计不够优化。引物与靶序列有非特异性互补或自身聚合成二聚体,可降低引物浓度进行优化,必要时重新设计引物。
(2) 模板
模板不纯,被污染,需重新制备模板。
模板降解或过量,通过电泳检查模板完整性及浓度,必要时重新纯化模板。模板的使用量请参考说明书。
(3) 反应程序
反应程序不够优化。如果出现比目的条带小的杂带,可通过提高退火温度,降低循环数调整;如果出现比目的条带大的杂带,可缩短延伸时间、降低循环数。
Q4:扩增产物跑胶条带弥散或拖尾。
A4:(1) 胶
制胶时要使胶完全融化。
(2) 引物
检查引物是否降解。
(3) 模板
模板降解或过量,可通过电泳检查模板完整性及浓度,必要时重新制备模板。模板的使用量请参考说明书。如果目的条带较长,模板是cDNA,要确认逆转录所用RNA的纯度及完整度,逆转录时不加随机引物重新逆转录。
(4) 反应程序
反应程序不够优化。退火温度不合适,可对退火温度设置梯度,摸索合适的退火温度;尝试Touch Down 程序。
Q5:空白对照出现扩增产物。
A5:(1) 引物设计不合理
扩增序列与非目的扩增序列有同源性,PCR也可以扩增出非靶序列的序列。
(2) 若扩增产物条带大小与目的条带一致,说明有污染
更换新的Mix、水或引物重复实验。反应体系在超净工作台内配制,减少气溶胶污染。
(3) 为了避免靶序列受到整个基因组或大片段的交叉污染,操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外。
(4) 为了避免靶基因受到空气中小片段核酸污染,可用巢式PCR方法减轻或消除污染。
Q6:高保真酶扩增保真性差,存在突变。
A6:高保真酶在PCR时扩增产物有突变,可以从以下几点来分析:
(1) 模板本身存在突变
检查模板,若模板是质粒,建议送质粒去测序;若模板是cDNA,建议重复实验,如果仍有突变,可能是cDNA有问题,建议重新制备cDNA,制备cDNA前检测RNA的完整度及纯度。
(2) 模板长时间在紫外光下照射,引入突变
切胶回收过程中避免长时间在紫外光下照射。
(3) 基因序列与NCBI上的不一致
建议再重复一次送去测序,若结果和上一次一样,说明序列可能和NCBI上的不一致。
(4) 少量序列存在非严谨序列
有相似重组序列,导致重组错位。
Q7:逆转录后的产物cDNA作为模板,使用高保真酶,一次应该加多少体积?
A7:说明书建议cDNA模板使用量为1-5μl(不超过PCR反应总体积的1/10),可在这个范围内尝试不同的使用量,摸索合适使用量。
Q8:带颜色的PCR产物(p520,p525扩增产物)是否影响酶切效果?
A8:经测试,带颜色的PCR产物不会影响酶切效果。
Q9:高保真酶扩增产物是否带A尾,如何加A尾
A9:(1)高保真酶扩增产物不带A,后续做克隆可尝试使用Vazyme无缝克隆产品C601;若进行TA克隆可用普通的Taq酶进行加A尾;
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